分子轨道理论是原子轨道的线性组合，而AO叠加本质是波函数的线性叠加.
在轨道能量方面，价键理论认为共价键的本质是原子轨道重叠，共用自旋相反的电子对使轨道能量降低；而MO的能量可以低于、等于或高于AO.
总的来说，分子轨道理论具有更完善的数学形式，可以很好地解释$O_2$的顺磁性，离域电子体系的结构和性质，证明分子的存在性以及判断其稳定性($He, H_2^{+}$等)
波函数叠加方式
根据MO理论，波函数叠加方式有两种：
1. 同相叠加：波增强，轨道能量降低，形成成键轨道(bonding molecular orbital)
2. 反相叠加：波相消，轨道能量升高，形成反键轨道(antibonding molecular orbital)；出现电子云密度始终为0的节面(node)
键级
成键分子轨道每比反键分子轨道多填入一对电子，两个原子之间就会形成一根键；两个原子之间成键的数目称为键级(bond order)
能量相近的AO才能够叠加，而AO叠加方式影响MO能级顺序.
分子轨道能级顺序
同核双原子的分子轨道
根据AO能量差，有以下几种叠加方式：
1. s-s叠加
2. p-p叠加
3. s-p混杂
异核双原子的分子轨道
在HF分子中，H的$1s$轨道（–13.4 eV）和F 的$2p$轨道（–17.4 eV）能量相近，$p_x$和$s$头碰头地叠加形成$\sigma_{sp}$分子轨道，剩下的$p_y$和$p_z$没有成键、轨道能量不变，记作非键轨道.
其中，电负性更大的原子，AO能量更低.
多原子分子的分子轨道
对于结构比较简单的分子，可以仿效VB理论，用杂化轨道来简化MO轨道的处理.
- $CH_4$
以$CH_4$为例，$C$的1个$2s$和3个$2p$轨道杂化，形成4个能量相同的$2sp^3$杂化轨道，分别与$H$相连，键角$109.5^{\circ}$：
- $C_2H_2$
$\pi$键来自未杂化的$p$轨道的overlap，因此$C$仅有1个$2s$轨道和2个$p$轨道参与杂化：
Reference
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